Heian sarayının zayıflamasıyla, taşradaki askeri klanlar (Bushi) kendi güç merkezlerini kurdu. İki büyük klan öne çıktı: Taira (Heike) ve Minamoto (Genji). Bu iki ailenin iktidar mücadelesi, 1180-1185 yılları arasındaki ‘Genpei Savaşı’na yol açtı ve Japon tarihini değiştirdi.
Genpei Savaşı, samuray efsanesinin doğduğu yerdir. Okçulukta usta atlı savaşçılar, onur, sadakat ve ölüm üzerine kurulu bir kodla savaştılar. Efsanevi savaşçı keşiş Benkei ve trajik kahraman Minamoto no Yoshitsune’nin hikayeleri bu savaşta yazıldı.
Savaşın finali, Dan-no-ura deniz muharebesinde (1185) yaşandı. Taira klanı yenilince, 6 yaşındaki İmparator Antoku, büyükannesi tarafından kucağına alınıp ‘suyun altında da bir başkent var’ denilerek denize atlandı ve boğuldu. İmparatorluk kılıcı denizin dibinde kayboldu.
Minamoto no Yoritomo’nun zaferi, sivil aristokrasinin sonu ve askeri yönetimin (Şogunluk) başlangıcıydı. Artık iktidar Kyoto’daki imparatorda değil, Kamakura’daki ‘Çadır Hükümeti’nde (Bakufu) olacaktı. Kılıç, kalemi yenmişti.
Detaylı anlatım: Japonya’nın Tarihi: Kuruluşundan Orta Çağ Dönemine Kadar